徠卡顯微鏡熒光蛋白光譜特性的簡介

2020-08-27 10:27:14 奧林巴斯顯微鏡

徠卡顯微鏡熒光蛋白光譜特性的簡介

熒光顯微鏡的前景極大地改變熒光蛋白在20世紀50年代的發(fā)現(xiàn)。 其出發(fā)點是水母水母綠色熒光蛋白(GFP)通過檢測Osamo下村 。 數(shù)百GFP的突變體后,熒光蛋白的范圍達到從藍色到紅色的光譜。 更多的熒光蛋白來自其它物種的像珊瑚蟲未來的出現(xiàn)偏移發(fā)射波長連到遠紅外區(qū)。 的可能性,這個調(diào)色板提供了科學(xué)家尋找他們的需求的絕佳選擇合適的熒光蛋白標記。 本文提供的最新替代品的概述,并提供了明確安排表中所有相關(guān)的光譜特性。

熒光蛋白光譜特性



 A熒光蛋白 維多利亞

綠色熒光蛋白或其變體的光譜特性在于氨基酸結(jié)構(gòu)上形成的發(fā)色團 (圖1)。這可以是在3位的氨基酸65-67或殘基的接近這個位置(例如YFP)。 除了關(guān)于發(fā)色團的主要突變,研究還對其他位點定向誘變進行,以提高其它因素,如蛋白質(zhì)的成熟和表達在異種細胞系統(tǒng)(例如,密碼子使用,蛋白質(zhì)折疊在生理溫度下)。 需要注意的是A. 維多利亞是一個比較原始的海洋生物,無全身發(fā)熱系統(tǒng)。

即使GFP是因為它的亮度和高光穩(wěn)定性的最流行的FP中的一個,它有兩個主要的缺點。 這些都是一定的敏感性至pH和輕微趨勢二聚化。 二聚化寡聚化是許多FP的一個問題。 他們的偏好凝集彼此可產(chǎn)生偽像或關(guān)于融合蛋白的定位和功能的誤解。 但是,科學(xué)家們想出了一些答案的問題了。 其中,非極性氨基酸被親水性的物品所取代的突變,在臨界位置(F223R,L221K和A206K)顯示降低的二聚化。 所有這一切都導(dǎo)致頻譜的改善以及實際性狀的遺傳變化進行了總結(jié)下“強化”的FP的名字。

在wtGFP的情況下,增強導(dǎo)致的EGFP(增強型綠色熒光蛋白)與在488nm處,而不是以前復(fù)雜的吸收光譜在395納米和475納米的單激發(fā)峰。 wtGFP的第一個變異版本(S65T突變)由Roger錢永健等人開發(fā)的。 比原來更亮5倍,并呈現(xiàn)出更短的熟化時間。 連同更好熟化效率,在37℃,根據(jù)另一個突變(F64L),這起著對人們在看活細胞中起重要作用。

一個非常有趣的GFP變體的最大的斯托克斯位移一個是藍寶石 。 的突變的位置附近的發(fā)色團(T203I)導(dǎo)致的最大激發(fā)至399納米,最大發(fā)射至511毫微米的改變。 這是112毫微米的斯托克斯位移。 翡翠是另一個GFP的修飾具有改進的光穩(wěn)定性和亮度和更有效的折疊在哺乳動物細胞中。

而所有的綠色熒光蛋白具有相對較高的亮度,藍色熒光蛋白通常從微觀的應(yīng)用減少了發(fā)光強度受到影響。 然而,它們用在因其他光譜特性的光學(xué)測定法。EBFP(增強型藍色熒光蛋白),通過多輪突變wtGFP構(gòu)成。 第一個(Y66H)跳過從綠色發(fā)光峰的藍色光譜。 多個突變,隨后,產(chǎn)生的蛋白質(zhì)具有最大激發(fā),在380nm處,并在發(fā)光最大值位于448納米。 這些光譜特性使其成為EGFP在FRET徠卡顯微鏡的合作伙伴。 最近的藍色熒光蛋白具有較高的量子產(chǎn)率和更好的耐光性是石青,SBFP2EBFP2。 一個有前途的EBFP繼任者是一個名為天狼這成為由于其極高的耐受性pH值(pH值從3-9穩(wěn)定)和其是用最短的發(fā)射波長至今的熒光蛋白信譽流行的一種蛋白質(zhì)。

第二個“藍色”類的GFP變異體是由青色熒光蛋白的形成: 國家重點計劃 。 酪氨酸與色氨酸(Y66W)和進一步的遺傳改變的置換導(dǎo)致具有改善的亮度和光熒光染料。 這ECFP具有雙峰的激發(fā)和發(fā)射光譜在433/445 nm 和475/503 nm納米。 亮度是只有大約40%的該綠色熒光蛋白。 一個突出的ECFP變體是蔚藍 ,它具有更高的消光系數(shù)和量子產(chǎn)率。 它比ECFP更亮的1.5倍,并用作與YFP FRET的一個伙伴。

甲GFP的突變不直接改變中的發(fā)色團的三個中心氨基酸之一導(dǎo)致黃色熒光蛋白的升高。YFPs具有由酪氨酸(T203Y)交換一個共同的蘇氨酸,在位置203。 這種氨基酸是β桶的一部分,并位于靠近所述發(fā)色團。 相比于綠色熒光蛋白,激發(fā)和發(fā)射屬性已被轉(zhuǎn)換到更長的波長與激發(fā)和發(fā)射最大值在514納米和527納米(EYFP)。EYFP的一個特征是它的pH值敏感性。 在pH6.5 EYFP只有約50%的熒光,這并不總是一個缺點。 當涉及到pH測量(如囊泡,內(nèi)體等),EYFP,可作為一個指標。 有趣的是,另外的突變(Q69M)開發(fā)出一種更好的酸穩(wěn)定性,并顯著改善了亮度(比EGFP亮的75%)。 這種蛋白質(zhì),它仍具有光穩(wěn)定性較差相比,EGFP,被稱為黃水晶 。 另一個YFP的突變體(F46L)呈顯著更快的成熟速度并且還改進的pH值電阻。 這種蛋白質(zhì)被命名為金星 ,是一種常見的FRET受體與蔚藍。

從珊瑚蟲熒光蛋白

正如人們可以從第一部分看到,大多數(shù)的FP,來自水母 維多利亞發(fā)射光中的藍色到黃色的光譜。 紅色熒光蛋白的缺失。 俄羅斯科學(xué)家Sergey A. Lukyanov封閉的差距時,他發(fā)現(xiàn)的FP的珊瑚蟲。 紅色的FP具有比其他的一大優(yōu)勢,因為在細胞中的紅色光譜少得多的自體熒光。 此外,他們通過較長的波長,這是很好的活細胞興奮。 較短波長的光確實給標本遠遠更大的傷害。 珊瑚蛋白的過度水母蛋白的另一個一般性的優(yōu)點是在37℃下它們的有效的成熟。 A. 維多利亞 GFP和衍生物不得不被遺傳修飾,以正確的方式折疊,珊瑚蟲綱蛋白成熟而不分子工程的必要性。 這可能是由于其生境的溫暖水溫。

  • 紅色熒光蛋白的分子結(jié)構(gòu)

  • 2:紅色熒光蛋白的分子結(jié)構(gòu)

發(fā)現(xiàn)在珊瑚蟲最常用的FP的第一和靜止1是紅色熒光蛋白 。 這個名字是從海葵香菇芨而得。 紅色熒光蛋白具有最大激發(fā),在558 nm和583 nm的發(fā)射峰。 然而,第一欣快停滯時結(jié)構(gòu)信息發(fā)布。 紅色熒光蛋白maturates遠遠慢于水母的FP和具有中間色團的階段。 這一階段發(fā)出的光在綠色光譜和成因等FPS重疊。如已經(jīng)在GFP節(jié)所提到的,紅色熒光蛋白也有另一個問題。 紅色熒光??鞍资且环N專性四聚體的傾向,以形成低聚物。 這可導(dǎo)致關(guān)于融合蛋白的定位和功能的誤解。 在一般的珊瑚蟲的FP具有相似的結(jié)構(gòu),以該多管水母FP的。 發(fā)色是藏在β桶結(jié)構(gòu),具有4納米×3納米(高×直徑)的大小。 不同之處在于,在珊瑚蟲β桶(圖2)的多橢圓形外觀。

與此同時,以綠色熒光蛋白“進化”,研究人員開始修改原來的紅色熒光蛋白,以克服其結(jié)構(gòu)性缺陷。 第二紅色熒光蛋白產(chǎn)生- 的DsRed2 -具有減小的寡聚物形成趨勢和更快的成熟速度,減少綠色發(fā)光的中間階段。 進一步誘變導(dǎo)致了紅色的FP其中已完全喪失其四聚體狀態(tài),但也喪失了一些它的量子產(chǎn)率(的DsRed2的25%)。 錢學(xué)森等人的這項工作。 是第一單體紅色熒光蛋白,因此被稱為mRFP1。

這mRFP1然后起點創(chuàng)立一組六單體的FP統(tǒng)稱為“mFruit”的。 他們的個人名得自其發(fā)光色:mHoneydew,mBanana,魔橙,mTangerine,mStrawberry和mCherry mCherry是最有用的,這些FP的,具有50%的該綠色熒光蛋白的亮度發(fā)射光中的610納米范圍內(nèi)。

最亮的FP到目前為止是mFruit派的追隨者,并具有名稱tdTomato。 只要它被遺傳改變,dTomato是一種專性二聚體。 但二聚化被避免通過將兩個二聚化的伙伴在一個分子。 兩dTomato單元由一個12個氨基酸的接頭偶聯(lián),產(chǎn)生串聯(lián)二聚體的FP tdTomato具有發(fā)射最大值在581納米和在最高的區(qū)域中的光穩(wěn)定性。

發(fā)射光譜,進一步移入遠紅光區(qū)域(630納米- 700納米)已創(chuàng)建另一個mFruit后繼時mPlum是mFruit構(gòu)件與任何mFruit蛋白質(zhì)在649 nm的最深的紅色發(fā)光。

科學(xué)地使用綠色熒光珊瑚蟲綱的蛋白質(zhì)的量是非常小的,這是不令人驚奇鑒于公知的,用戶友好的A的情況的維多利亞 GFP。 顯然,人們并沒有看到任何必要建立一個新的綠色熒光蛋白。 不過也有一些,比如從石珊瑚Galaxeidae,Azami綠色明亮的熒光蛋白。 其序列同源性與綠色熒光蛋白是有趣小于6%。

一個珊瑚蟲綱FP這對深部組織成像的高影響Katushka。 對招標書的E.未來應(yīng)用誘變 ???/em> ,Katushka被鑒定為具有發(fā)射最大值在635納米和所有的深紅色熒光蛋白的最高亮度級一種二聚體蛋白質(zhì)。 Katushka的單體形式被稱為mKate并具有較高的亮度,供給以后,產(chǎn)生mKate2。

總之,所有這些今天用于顯微術(shù),熒光蛋白是來自于原始的海洋生物。 表1包括最重要的那些連同像激發(fā)和發(fā)射最大值,耐光性,量子產(chǎn)率和亮度及其相關(guān)的光譜特性。

展望

什么被證明是一個非常有趣的故事是由脊椎動物表達了FP的發(fā)現(xiàn)。 文昌魚,一條小魚般的海洋脊索動物,產(chǎn)生AmphiGFP在其前側(cè)。 那個FP的序列分析預(yù)測一個典型的β桶結(jié)構(gòu),似乎是相關(guān)的橈足類Pontellina plumataCopGFP(甲殼綱)。 這一發(fā)現(xiàn)表明,熒光的現(xiàn)象并不限于原始的無脊椎動物,但也可以在更高的進化階段動物中發(fā)現(xiàn)。 此外,這一發(fā)現(xiàn)表明熒光蛋白的發(fā)現(xiàn),處理和增強這仍然是研究的熱門話題的持續(xù)的過程。 這一事實證實的重要性和熒光蛋白在近期和未來生命科學(xué)研究的高沖擊。

熒光蛋白的光譜特性

表1:熒光蛋白
Ex:激發(fā)波長峰值(nm) 

Em:發(fā)射波長峰值(nm)

MW:分子量 
QY:量子產(chǎn)率 
BR:亮度; 消光系數(shù)*量子產(chǎn)率/ 1000 
PS:耐光性; 時間以50%的亮度(秒)

熒光蛋白


Ex (nm)

Em (nm)

MW

QY

BR

PS

Source

Other

Y66H

360

442







Y66F

360

508







EBFP

380

440


0.18

9


Addgene

Monomer

EBFP2

383

448


0.56

18


Addgene

Monomer

Azurite

383

447


0.55

14



Monomer

GFPuv

385

508







T-Sapphire

399

511


0.60

26

25


Weak dimer

TagBFP

402

457

26 k

0.63

33

++

Evrogen

Monomer

Cerulean

433

475


0.62

27

36


Weak dimer

mCFP

433

475


0.40

13

64


Monomer

ECFP

434

477


0.15

3




CyPet

435

477


0.51

18

59


Weak dimer

Y66W

436

485







dKeima-Red

440

616


0.31

8


MBL

Dimer

mKeima-Red

440

620


0.24

3


MBL

Monomer

TagCFP

458

480


0.57

29


Evrogen

Dimer

AmCyan1

458

489


0.75

29


Clontech

Tetramer

mTFP1 (Teal)

462

492


0.85

54



Dimer

S65A

471

504







Midoriishi-Cyan

472

495


0.9

25


MBL

Dimer

Wild Type GFP

396,475

508

26 k

0.77

16




S65C

479

507







TurboGFP

482

502

26 k

0.53

37


Evrogen

Dimer

TagGFP

482

505

27 k

0.59

34

++

Evrogen

Monomer

TagGFP2

483

506

27 k

0.6

34

++

Evrogen

Monomer

AcGFP1

484

510

27 k

0.82

27


Clontech


S65L

484

510







Emerald

487

509


0.68

39

0.69

Invitrogen

Weak dimer

S65T

488

511







EGFP

488

507

26 k

0.60

34

174

Addgene

Weak dimer

Azami-Green

492

505


0.74

41


MBL

Tetramer (monomeric available)

ZsGreen1

493

505

105 k

0.91

40


Clontech

Tetramer

Dronpa-Green

503

518


0.85

81


MBL

Photoswitchable

TagYFP

508

524

27 k

0.62

47


Evrogen

Monomer

EYFP

514

527

26 k

0.61

51

60


Weak dimer

Topaz

514

527


0.60

57



Monomer

Venus

515

528


0.57

53

15


Weak dimer

mCitrine

516

529


0.76

59

49


Monomer

>YPet

517

530


0.77

80

49


Weak dimer

TurboYFP

525

538

26 k

0.53

56


Evrogen

Dimer

PhiYFP

525

537

26.8 k

0.40

52

++

Evrogen

Weak dimer

PhiYFP-m

525

537

26.8 k

0.39

48

++

Evrogen

Monomer

ZsYellow1

529

539


0.65

13


Clontech

Tetramer

mBanana

540

553


0.70

4


Clontech

Monomer

Kusabira-Orange

548

559


0.60

31


MBL

Monomer

mOrange

548

562


0.69

49

9


Monomer

mOrange2

549

565


0.60

35


Clontech

Monomer

mKO

548

559


0.60

31

122


Monomer

TurboRFP

553

574

26 k

0.67

62


Evrogen

Dimer

tdTomato

554

581


0.69

95

98

Clontech

Tandem dimer

DsRed-Express2

554

591


0.42

15


Clontech


TagRFP

555

584

27 k

0.48

48


Evrogen

Monomer

DsRed monomer

557

592

~28 k

0.1

3.5

16

Clontech

Monomer

DsRed2 ("RFP")

563

582

~110 k

0.55

24


Clontech


mStrawberry

574

596


0.29

26

15

Clontech

Monomer

TurboFP602

574

602

26 k

0.35

26


Evrogen

Dimer

AsRed2

576

592

~110 k

0.21

13


Clontech

Tetramer

mRFP1

584

607

~30 k

0.25



Tsien lab

Monomer

J-Red

584

610


0.20

8.8

13


Dimer

mCherry

587

610


0.22

16

96

Clontech

Monomer

HcRed1

588

618

~52 k

0.03

0.6


Clontech

Dimer

mKate2

588

633

26 k

0.40

25

+

Evrogen

Monomer

Katushka (TurboFP635)

588

635

26 k

0.34

22

++

Evrogen

Dimer

mKate (TagFP635)

588

635


0.30

15


Evrogen

Monomer

TurboFP635

588

635

26 k

0.34

22


Evrogen

Dimer

mPlum

590

649


0.10

4.1

53

Clontech


mRaspberry

598

625


0.15

13


Clontech

Monomer; faster photobleach than mPlum

mNeptune

600

650


0.20

13


Tsien Lab

Monomer

E2-Crimson

611

646


0.23

29


Clontech